Ein Krähennest verschwindet plötzlich von einem Baum. Doch wie kann das sein? Und was ist, wenn Eier darin waren? Josefine setzt alles daran, das so schnell wie möglich herauszufinden. Denn die Eier dürften nicht zu stark auskühlen. Auch die Krähenmutter verhält sich unruhig. In Lüttkewitz' Garten trifft Josefine Schildkröte Törtel. Er hilft ihr die Eier zu finden. Jetzt liegt es an Josefine sie zu retten.

Josefines Mutter und Tierärztin Anna diagnostiziert eine Vergiftung bei Frau Fitzwitz' Hund Nofretete. Josefine will herausfinden, wie das passiert ist, bevor noch mehr Tiere betroffen sind. Sie geht die übliche Gassi-Runde der beiden ab, doch kann nichts finden. Währenddessen häufen sich die Fälle von Vergiftungen in der Tierarztpraxis und Josefine muss schnellstmöglich aufklären, was hier in Müggeldorf vor sich geht.

Ein panischer Schwan stürmt das Café von Josefines Oma in Müggeldorf. Er steckt mit dem Kopf in einem Pappbecher fest und kann nichts sehen. Josefine startet eine Rettungsaktion. Gemeinsam mit Bruder Paul und Papa Mario will sie den Schwan nach einer wilden Bootsfahrt befreien. Dabei stellt sie fest: Das ganze Müggeldorfer Seeufer ist mit Müll verschmutzt und der muss entfernt werden, um die Tiere davor zu schützen.